顯微鏡下金葡菌基因組DNA提取的技巧
一、組織抽提:
1. 顯微鏡下取組織塊50-100㎎用液氮在研缽中研磨成粉末
2. 移入1.5ml新離心管用5 ml針頭抽打
3. 移入玻璃勻漿器加入1ml Trizol 抽打勻漿
4. 冰上孵育5分鐘
5. 離心12,000g 4℃ 5分鐘 取上清液移入1.5ml新離心管
6. 加0.2 ml氯仿,震蕩,冰上孵育5分鐘
7. 離心<12,000g 4℃ 10分鐘 取上層液相移入1.5ml新離心管
8. 加0.5 ml異丙醇,震蕩,冰上孵育5分鐘
9. 離心<12,000g 4℃ 5分鐘 棄去上清液
10. 加入1 ml 75%乙醇,震蕩
11. 離心<7,500g 4℃ 5分鐘 棄去上清液
12. 室溫下使之變透明
13. 加入DEPC處理水10μl --35μl 溶解RNA( 可保存在液氮或低溫冰箱)
14. 走RNA變性電泳觀察18s,28s條帶,分光光度計檢測260/280吸光度比值,計算RNA濃度
二、RT反應體系(第一步):約20分鐘
RNA 抽提物
5μl
Radome 引物
2μl
RNA sin
0.5μl
1. 65℃ 15分鐘
2. 立即放入冰浴
RT反應體系(第二步):約2小時
RNA sin
0.5μl
10mM dNTP
1μl
5×RT 緩沖液
4μl
25mM MgCl2
4μl
AMV 逆轉錄酶
3μl
1. 37℃ 1.5小時
2. 94℃ 5-10分鐘
3. 反應物保存于-20℃或進行PCR
三1、PCR反應體系:約4.5小時
25mM MgCl2
2μl
10×PCR 緩沖液
5μl
10mM dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
2.5μl
ddH2O
34μl
Taq酶
0.5μl
輕質石蠟油
50μl
100μl
1. 94℃ 2分鐘,55℃ 1分鐘,72℃ 2分鐘 為第一個步1個循環
2. 94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分鐘 為第二步30個循環
3. 72℃ 10分鐘
4. 取出后4℃ 5分鐘后-20℃保存或走電泳
三2、PCR反應體系:約5小時
25mM MgCl2
3μl
10×PCR 緩沖液
5μl
10mM dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
5μl
ddH2O
30μl
Taq酶
1μl
輕質石蠟油
50μl
100μl
1. 94℃ 2分鐘,55℃ 1分鐘,72℃ 2分鐘 為第一個步1個循環
2. 94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分鐘 為第二步40個循環
3. 72℃ 10分鐘
4. 取出后4℃ 5分鐘后-20℃保存或走電泳
四、電泳:約1.25小時
1. 配0.5×TBE電泳緩沖液300 ml
2. 膠濃度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g膠)
3. 微波爐中火2分鐘溶解膠
4. 冷卻至60℃加入溴乙錠2μl(10mg/ml的終濃度0.5μg/ml)
5. 放入梳子,澆板,待凝固
6. 加8μl PCR反應產物+2μl溴酚蘭
7. 電泳50-80V(每㎝ 5V)
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