顯微鏡許多不同的品種在市場上，每一種顯微鏡都擁有特定的應用功能：

普通光學顯微鏡 - 采用一個鏡頭，彎曲的鏡頭，在放大過程中。這種類型的顯微鏡是由安東列文虎克17世紀發明的。

復合光學顯微鏡 - 光學，短焦距端到端客觀的角度打算,生物顯微鏡。許多光學系統的工作，以減少色差以及球面像差，因此方面是清楚的,體視顯微鏡，不受影響的。

立體顯微鏡，它也被稱為解剖顯微鏡，并采用兩個獨立的光學軸（雙眼）產生一個三維圖像。這種顯微鏡進行顯微分析，手表，小電路板制造，等等。

倒置顯微鏡：這各種顯微鏡比常規顯微鏡倒置的位置。倒置顯微鏡專注于液體內的細胞培養的研究。

巖相顯微鏡：這一類顯微鏡的特點偏光過濾系統，一個旋轉的立場，和石膏板。巖相顯微鏡集中在無機物質的研究，往往在不斷變化的角度改變其屬性。

袖珍顯微鏡：這種顯微鏡與這種舊式的顯微鏡相比較可以便攜方便攜帶,偏光顯微鏡。

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