原子力顯微鏡是新興顯微鏡，仍然有一些帶改進，但它是目前正在應用于深奧的學科，在電子，化學和生物等領域的廣泛的研究

原子力顯微鏡，掃描電子顯微鏡（SEM）的優勢。之一，原子力顯微鏡可以在周圍的空氣或液體環境功能，不像電子顯微鏡需要在真空中進行，所有探頭。鑒于此，研究人員已經開始檢測原子力顯微鏡的適用性研究在納米尺度的生物體（例如，掃描和研究生物大分子,倒置生物顯微鏡，如DNA等等）。

一方面，原子力顯微鏡可以繪制三維圖像;

但是SEM只可以提供一個二維圖像或投影樣品。

另一方面，一個原子力顯微鏡的主要缺點是它可以掃描的區域，它可以產生的圖像分辨率。可以掃描電子顯微鏡以毫米為單位計量的面積;

相關資訊：

顯微鏡實驗室活動課程教學目標

立體顯微鏡是在科學領域主要用于比較兩個標本

立體顯微鏡，形成一個三維立體視圖

立體體視顯微鏡可用于昆蟲識別電路板維修